O Programa de Pós-Graduação Stricto Sensu em Mecatrônica (PósMecatrônica) foi criado a partir da excelência do IF-SC como Centro Universitário e do GDMAES - Grupo de Pesquisa e Desenvolvimento de Máquinas Automáticas Especiais – tendo sido motivado pela necessidade de formação de pessoal com alto nível de qualificação no desenvolvimento de soluções inovadoras envolvendo sistemas mecatrônicos. A PósMecatrônica está vinculada ao Departamento Acadêmico de Metal-Mecânica do IF-SC, e oferta a partir de 2009 o curso de Mestrado Profissional em Mecatrônica.

A área de Mecatrônica integra a Engenharia Mecânica de Precisão com a Eletrônica e o Controle Computadorizado Inteligente, para inovar produtos e processos de manufatura. O Mestrado em Mecatrônica atua nesta integração tecnológica e, estando na modalidade de Mestrado Profissional, prioriza o desenvolvimento de trabalhos em parceria e valoriza a participação de profissionais de empresas e instituições de C&T. A estrutura curricular e a realização do curso são configuradas para oportunizar esta participação de profissionais da indústria no Mestrado.